С 2003 года и по настоящее время под руководством доктора медицинских наук Владимира Леонидовича Козловского актуальные исследования ведутся в рамках научной темы оптимизации лечения больных с психическими нарушениями. Выдвинуто положение о том, что перспективы лекарственной терапии могут быть достигнуты в результате разграничения патогенетических механизмов заболеваний и соблюдении базовых стратегий лечения при фармакодинамически согласованном адъювантном назначении других препаратов. В настоящее время работы отделения касаются аспектов формирования лекарственной резистентности и способов ее преодоления, базирующихся на основе вероятностных нейрохимических нарушений деятельности мозга, сформированных в ходе эволюционного и онтогенетического развития. Предложена концепция формирования нейрохимического лекарственного гомеостаза, определяющего развития поведенческих реакций в рамках модуляции синаптической передачи моноаминергических систем в детерминированных и в функционально-лабильных нейрональных сетях, обеспечивающих эволюционно детерминированные ответы и их модуляцию на этапах интегративного взаимодействия в локально-распределенных сетях ЦНС.
Поиск путей преодоления лекарственной резистентности и оптимизации терапии психических нарушений проводится на основе выделения потенциальных нейробиологических факторов эффективности (сопоставление клинических проявлений заболевании с определением потенциально задействованных в патологии медиаторных систем мозга) и предложением индивидуализированной схемы терапии. Активно исследуются механизмы развития резистентности при терапии антипсихотическими и антидепрессивными препаратами. Результаты проведенных исследований отражены в многочисленных статьях, справочнике, монографиях, пособиях для врачей, методических рекомендациях.